水草肥料的常用种类有基肥、根肥、液肥、铁肥等。基肥和根肥埋入底砂使用，液肥直接倒入水中使用。在平时养殖过程中，合理使用肥料是养好水草的关键之一。
1、根据水草品种施肥
水草品种不同，对必需的营养元素需求量有很大差异，尤其在微量元素上，表现得更为突出。元素在水草体内的含量与水草对其需要量有一定的相关性。如需铁量多的水草，其体内含铁量也多，对铁的耐受性也强。严格说，每种水草都应该有自己的一套肥料配方，但生活中这并不现实。自然生长在世界不同水域的不同水草被汇集在一起，它们只能也必须适应相同的条件。好在现在的肥料能满足绝大部分水草的基本需要，使它们在水族箱中即使达不到最佳状态，也基本能够满足我们的观赏需求。
最突出的一个例子就是红色系水草。比较常用的液肥，其中各种元素的比例只是取了各种水草需求量的平均值，好的液肥能够保证大多数水草的需求。但如果想让红草更红，就需要额外添加铁肥。液肥中也含铁，但它的含量并不很高，不足以完全满足红草合成花青素的需求。
2、根据水草类型施肥
水草的类型可以粗分为有茎类水草、丛生性水草和附着类水草。其中丛生性水草的根系最为发达，所以使用基肥会让它们更有效的吸收养分。而且它们发达的根系可以溶解基肥中的营养元素并释放到水中，对其他水草也有好处。对于有茎类水草，如果有基肥更好，否则应施用根肥。而附着类水草只用液肥维持也可以达到不错的效果。
3、根据水温施肥
普通热带水草生长最旺盛的水温为24到27度，过高或过低都会影响光合作用的强度，同时也就影响了水草对营养元素的吸收，所以在水温过高或过低的时候应该适当减少肥料的施用量以避免藻类的横行。
4、根据饲养水草的配套设施施肥
如果草缸光照足够、添加二氧化碳、又种植满缸速生性水草，则应该增大施肥量，但要注意藻类情况和水草的生长状态，以便及时调整用量。
5、根据水草的多寡施肥
可根据种植水草的多少决定肥料的用量，说明书上的添加量只是个参考值。 但如果草缸中只养一些阴性草，即使数量不少，也要减少肥料用量，因为阴性草的需肥量不大，过多施肥容易滋生藻类和引起肥伤，要本着“薄肥勤施”的原则。
6、根据换水量和频率施肥
如果换水量大又频繁的话，就要适当增加肥料用量，反之就要减少肥料用量。
7、根据藻类的多少施肥
如果草缸中水草生长旺盛而藻类又较少时，说明肥料使用量是合适的。反之，如果藻类过多，则要适当减少肥料特别是铁肥的用量，因为过多的铁会促进藻类的泛滥。
8、根据水质施肥
水质的好坏特别是水质的酸碱度的高低对肥效是有影响的。偏碱的水质对于某些元素，比如铁元素有不利的影响。最好把水质调整到弱酸性，更有利于水草对肥料中各种元素的充分吸收。另外水质的硬度对肥效也有影响，过多的钙、镁离子会干扰其他元素的吸收，所以最好把硬度调整到水草能够适应的范围。
综上所述，水草施肥不要盲目机械地照搬肥料说明书上的用量，要根据自己的实际情况适当加以增减才可以达到物尽其用的效果。
刚设立（新开缸）的水草缸，应该在一周或是十天之后，再添加液肥。
开始时适量少加（正常量的一半左右）。之后视水草的转水和生长情况在逐渐加量，以免过多的液肥造成藻类的滋生（俗称爆藻）。
另外注意事项：
1、水草缸必须加液肥。
只有少数水草可以容忍较低的营养供应而不死亡，但完全无肥也会死亡。液肥是需要的，只是加多加少而已。
2、不可以使用养花草的那种肥料。
水生植物以及水草缸观赏对于肥料成分的比例和种类有特殊的要求，养植花卉的肥料是无法满足的。使用这些肥料有可能造成水草营养不良或者藻类爆发。
3、液肥的价格相差很多，使用效果有很大不同。
不同品牌的液肥的营养浓度有高低，成分比例有不同，和日常维护的配合难易也有不同。因此，也就有了“品质”上的不同。所谓劣质液肥，是指那些营养比例极不均衡，甚至缺乏某些必要的元素的劣质品。这些液肥在使用中极易发生暴藻现象，并且有时对水草和鱼虾会发生毒害作用。同样，购买时需要看口碑和品牌。尤其是在养植某些养植难度较高的水草时，应该慎重选用液肥。
水草液肥是一种液体肥料，就是把有机肥料或化学肥料与水融合后直接喷洒于植物叶面或根部，让其吸收较为快速。从而影响植被生长。水草类有机液态肥料化学成分的配比单，俗称水草液肥配方。
养水草用基肥、根肥、液肥。
大部分水草需要着根生长，所以草缸底部需要铺基肥，并在大型水草和红色系水草下追加根肥。注意：如果用的是底部过滤就不能使用基肥和根肥了。
液肥是水草的“主食”，需要每天添加，添加量由于各品牌的配制浓度不同所以不统一。建议您按其说明书的半量添加。
间隔时间长，其新鲜程度差，其中的很多微量元素已经氧化，所以最好自己配，液肥应该避光保存，用后盖紧盖子。
观赏：
栽种水草要有层次，可以多种配合混种，同时应考虑到不同水草对光照、水温、水质等的不同要求。在布局方面应力求高低参差，错落有致；水草与山石，沉木的位置也要力求左右平衡，保持画面和谐，植株高长，枝叶茂盛的水草应栽于山石后；
一些茎较短小的水草，应栽于石缝中，作为中景，如水榕，网草，西瓜草等。一些有匍匐茎的水草适宜作前景，如珍珠草，香菇草等。水草种植密度不太大，应留有一定间距，做到画面协调，景物组合完好。
